Фамилия Шеянкина — женская форма фамилии Шеянкин. В русской традиции такие фамилии образуются прибавлением суффикса -а к мужскому варианту, и это указывает на то, что носительница — женщина, дочь или жена Шеянкина.

Мужская фамилия Шеянкин, в свою очередь, образована от прозвища Шеянка. Суффикс -ин типичен для центральных и северных областей России: он указывает на принадлежность «сын Шеянки» или «человек из семьи Шеянки». Само прозвище Шеянка, скорее всего, имеет диалектную основу. В русских говорах слово «шея» могло относиться не только к части тела, но и к узкому проходу, перешейку, или к человеку с длинной, тонкой шеей. Однако есть и другая, более редкая версия: Шеянка могло быть уменьшительной формой от нецерковного имени Шей, которое иногда давали по внешнему признаку или по названию ремесла (например, от «шить» — швея, портной, но с фонетическим изменением).

Географически фамилия Шеянкин встречается в Поволжье и в центральных регионах России, особенно в Чувашии и Татарстане, где есть тюркское влияние. В чувашском языке слово «шей» означает «болото», «топь», и прозвище Шеянка могло относиться к человеку, жившему у болотистого места. Эта версия объясняет редкий корень, не характерный для типичных русских прозвищ: фамилия могла возникнуть на стыке культур, когда русское окончание -ин прикрепили к тюркской основе. Таким образом, предки Шеянкиных могли быть крестьянами или мелкими ремесленниками из смешанных по этническому составу районов, где прозвища давали по ландшафту или занятию.