Фамилия Шеянков образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от прозвища или имени с помощью суффикса -ов. Основа здесь — «Шеян». Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — «Шеянов сын», со временем закрепившийся как фамилия.

Корень фамилии восходит к прозвищу «Шея». Прозвища по частям тела давали часто, и они могли указывать на внешность (длинная, короткая, толстая шея), манеру держаться (человек с гордой или, наоборот, втянутой шеей) или на род занятий. В говорах слово «шея» имело и переносные значения: так могли назвать упрямца, навязчивого человека или того, кто постоянно «висит на шее» — просит, требует. Есть и другая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «шея» — это часть снасти, воротник одежды или даже название рыбы. Но наиболее вероятно, что прозвище было связано с внешностью или характером.

Форма «Шеян» — это нестандартный вариант. Обычно от «Шея» образовывали фамилию «Шеин» (с суффиксом -ин). Суффикс -ан (в форме Шеян) встречается реже и часто придаёт слову оттенок уменьшительности, ласкательности или, наоборот, пренебрежения. «Шеян» могло означать «маленькая шея» или «шея-коротышка», а могло быть и просто производным прозвищем, которое затем закрепилось в фамилии.

Географически фамилия Шеянков встречается нечасто. Основные очаги — центральные и северные области России, где суффикс -ов в фамилиях преобладал. В южных и западных регионах, где более типичны фамилии на -енко или -ук, она почти не фиксируется. Таким образом, предки носителей фамилии Шеянков, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми из центральной России. Прозвище Шеян дали одному из них, а его потомки стали Шеянковыми.