Фамилия Шейбаранов образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ов. Это указывает на то, что в основе лежит прозвище или имя, заканчивающееся на согласный: Шейбаран. Суффикс -ов означает принадлежность, то есть Шейбаранов — это буквально «сын Шейбарана» или «потомок Шейбарана».

Корень фамилии — «шейбар» — не имеет прямых славянских параллелей. Скорее всего, он тюркского происхождения. В тюркских языках (особенно в татарском, башкирском, казахском) распространены имена и прозвища, образованные от слов «шейх» (духовный наставник, старейшина) и «бар» (есть, имеется). Таким образом, Шейбаран могло означать «имеющий шейха» или «тот, у кого есть шейх», что в переносном смысле могло быть прозвищем ученика, последователя или человека, живущего при обители. Суффикс -ан в тюркских именах часто придаёт значение обладания или принадлежности.

Вероятно, фамилия Шейбаранов имеет корни в среде татарских или башкирских мурз и служилых людей, которые после присоединения Поволжья и Приуралья к Русскому государству переходили на русскую службу и получали земельные наделы. Их фамилии нередко русифицировались добавлением окончания -ов. В таком случае, предок Шейбарановых мог быть человеком, связанным с мусульманским духовенством или просто носителем тюркского имени Шейбаран.

Менее вероятно, но возможно, что основа «шейбар» восходит к иранскому или кавказскому корню, однако без дополнительных географических данных (например, если фамилия встречается в Дагестане или Азербайджане) эта версия остаётся спекулятивной. Наиболее правдоподобной выглядит тюркская этимология с религиозным оттенком.

Фамилия редкая. Её носители, скорее всего, сосредоточены в регионах с исторически смешанным русско-татарским населением — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской или Челябинской областях. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках эта фамилия практически не фиксируется, что говорит о её позднем закреплении или малой численности рода.