Фамилия Шейбин образована от прозвища Шейба. В русских говорах слово «шейба» имело несколько значений, но все они связаны с бытом и ремеслом. В первую очередь, шейбой называли металлическую прокладку, кольцо или шайбу — отсюда и современное техническое значение слова. Однако в диалектах «шейбой» могли назвать и нечто круглое, приплюснутое, а также человека с такой внешностью — например, круглолицего или приземистого. Ещё одна версия возводит прозвище к глаголу «шить»: шейбой в некоторых регионах называли портного или человека, занимающегося починкой одежды. Эта версия подкрепляется тем, что суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Шейбин — «сын Шейбы», то есть потомок человека с таким прозвищем или ремеслом.

Фамилия относится к распространённому типу русских фамилий на -ин, образованных от имён, прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а/-я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще возникали от основ на твёрдый согласный, -ин характерен для основ на -а. По этой модели возникли, например, Пушкин (от прозвища Пушка), Репин (от Репа) и сама Шейбин. Интересно, что фамилия не слишком часто встречается в центральных областях России — её география тяготеет к южным и волжским регионам, где слово «шейба» в значении «шайба» или «круглый предмет» бытовало активнее. Встречаются также варианты написания Шайбин, что может указывать на диалектное произношение с аканьем.

Несмотря на то что фамилия Шейбин не принадлежит к числу древних боярских или дворянских родов, она хорошо вписывается в пласт русских фамилий, возникших из прозвищ по внешности или занятию. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались в основном среди крестьян и мещан, что типично для «ремесленных» фамилий. Сегодня она остаётся редкой, но узнаваемой: её носители живут в разных частях России, и каждый может проследить свою линию до того самого Шейбы — круглолицего мастера или портного, чьё прозвище закрепилось за родом.