Фамилия Шейнкарь — редкий случай, когда основа прямо указывает на занятие предка, но при этом звучит не по-русски. В ней безошибочно угадывается немецкое слово Schein (свет, блеск, видимость) и Karren (тележка, повозка) или Karre. Однако прямой перевод «светлая тележка» смысла не даёт. На самом деле перед нами искажённое немецкое Schreiner — столяр, краснодеревщик. В южнонемецких диалектах и в идише это слово произносили как «шайнер» или «шейнер», а русское ухо и письмоводители переделали его в «Шейнкарь», добавив характерный суффикс деятеля -арь (как в словах «псарь», «звонарь», «пекарь»). Так фамилия стала понятнее носителям языка: она зазвучала как обозначение мастера, хоть и с чужой корневой основой.

Второй вариант, который предлагают некоторые исследователи, — связь с идишским sheyn (красивый) и ker (поворот, дело). Тогда Шейнкарь — это «красильщик» или «отделочник», то есть тот, кто придаёт вещам приглядный вид. Но эта версия слабее: суффикс -арь в таком прочтении выглядит натяжкой, а профессиональное прозвище столяра-краснодеревщика встречается в документах гораздо чаще.

По модели образования фамилия типична для западных губерний Российской империи — территорий современной Беларуси, Украины и Польши, где было сильно немецкое и еврейское ремесленное население. Окончание на -ь (Шейнкарь) указывает, что фамилия закрепилась в мужском роде по типу существительных второго склонения, что для русских фамилий редкость: обычно они выглядят как прилагательные (Шейнкарев) или на -ин. Форма Шейнкарь — более старая, «прозвищная», не успевшая обрасти патронимическим суффиксом.

Таким образом, предок носителя этой фамилии с большой вероятностью был столяром-краснодеревщиком, работавшим с дорогими породами дерева. В крестьянской среде такая специализация встречалась нечасто — скорее всего, он жил в местечке или городе, где ценилось тонкое ремесло. Фамилия сохранила память о профессии, которую в оригинале обозначали немецким словом, но перекроили на русский лад, сделав её «своей» для уха и удобной для письма.