Фамилия Шейтанов — редкий случай, когда основа вызывает почти мгновенную ассоциацию с тюркским словом «шейтан» (сатана, дьявол, чёрт). Однако в русских фамилиях эта основа редко несёт прямой религиозный смысл. Чаще всего за ней стоит прозвище, данное человеку с озорным, «бесовским» характером или внешностью — смуглому, черноволосому, верткому. В тюркских языках слово могло употребляться и как шутливое обращение к хитрому, ловкому человеку, почти без отрицательной окраски.

Модель образования проста: тюркское прозвище Шейтан (или его вариант) плюс русский патронимический суффикс -ов. Суффикс указывает на то, что фамилия формировалась в русской среде, скорее всего, в XVI–XVII веках, когда на южных и восточных окраинах государства активно смешивались русские и тюркские элементы. Носитель фамилии — потомок человека, которого в документах или в быту записали как «Шейтан» или «Шейтанов сын».

Интересно, что в некоторых диалектах русского севера и Сибири «шейтан» могло означать нечистую силу, но в фамилиях эта основа практически не встречается за пределами южнорусских и поволжских областей. Это указывает на региональную привязку: скорее всего, предки Шейтановых жили в районах контакта с татарами, башкирами, казахами — на Урале, в Оренбуржье, в Поволжье. Встречается фамилия также у кубанских казаков, где тюркские заимствования были обычным делом.

Версия о происхождении от еврейского имени Шейтан (в иудаизме — сатана, противник) менее вероятна. Такая фамилия была бы крайне редкой и, скорее всего, имела бы суффикс -ин или -ский, а не -ов. Поэтому основная гипотеза — тюркское прозвище, русифицированное в XIX веке при записи в метрические книги.