Фамилия Шлейтанов — редкая и с трудом поддающаяся однозначному толкованию. Её основа, «Шлейтан», почти наверняка не славянского происхождения, а модель с суффиксом -ов указывает на типичный способ русификации: нерусское прозвище или имя «обкатали» по образцу русских фамилий, добавив патронимический формант.

Самая вероятная версия — тюркская. В татарском, башкирском и других тюркских языках есть корень «шлей» или «шлейт», который может восходить к слову со значением «кнут», «плеть» или «бич». В таком случае Шлейтан — это прозвище человека, который либо делал кнуты, либо, в переносном смысле, был строгим, «хлестким» в словах или поступках. Суффикс -ан в тюркских именах и прозвищах часто придаёт усилительное значение или просто оформляет слово, поэтому «Шлейтан» могло означать «тот, кто с кнутом» или «кнутобой». В пользу этой версии говорит и то, что фамилия встречается в Поволжье и на Урале — регионах с давним тюркским влиянием.

Менее вероятна, но возможна немецкая версия. Слово «Schleiter» в немецких диалектах могло означать «тот, кто тащит, волочит» (от schleiten — тащить), либо относиться к профессии, связанной с обработкой кожи (шлейтен — разминать кожу). Однако фамилия Шлейтанов не типична для поволжских немцев: немецкие фамилии в России обычно русифицировались иначе (Шлейтер → Шлейтеров). Форма на -анов скорее характерна для тюркской адаптации.

Третья, самая спорная гипотеза — связь с еврейским именем Шлойме (Соломон) через идиш. Но превращение Шлойме в Шлейтан — фонетически натяжка, и такая версия не подкреплена географией фамилии.

Скорее всего, предок носителя фамилии Шлейтанов — тюркский ремесленник (шорник или плетельщик) либо человек с прозвищем, данным за характер. Фамилия осталась редкой, потому что исходное прозвище не было распространённым, а её носители не составляли большого рода. В современных справочниках она почти не упоминается, что только подтверждает её локальное, вероятно, южноуральское или башкирское происхождение.