Фамилия Шибатовский — это редкий пример фамилии, образованной не от прямого прозвища, а от названия места, которое, в свою очередь, произошло от личного имени. В ономастике такие фамилии называют топонимическими, и их модель — суффикс -ский — в русской традиции указывает на дворянское или шляхетское происхождение, хотя на практике её часто давали и простым людям, переселенцам из конкретного села.

Корень фамилии — Шибат. В основе лежит либо прозвище Шибат, либо уменьшительная форма от крестильного имени. Наиболее вероятная версия: Шибат — это производное от канонического имени Шиба, которое встречается в святцах как вариант имени Сива (библейского происхождения). В народной среде имя трансформировалось в Шиба, а с уменьшительным суффиксам -ат (как в именах Гаврила — Гаврилат, Фома — Фомат) дало форму Шибат. Менее вероятна связь с глаголом «шибать» (бить, кидать) — такие прозвища обычно давали драчунам, но они образовывали фамилии на -ов (Шибалов, Шибанов), а не на -ский.

Фамилия Шибатовский могла возникнуть двумя путями. Первый: предок носил прозвище Шибат, а его потомки стали Шибатовскими по модели «чей?» — то есть «сын Шибата» с последующим добавлением дворянского суффикса. Второй, более логичный для суффикса -ский: существовал населённый пункт Шибатово (или Шибатовка), а его выходцы записывались как Шибатовские. Такие селения встречались в западных губерниях Российской империи — на территории современной Беларуси и Украины, где топонимы на -ово/-ево часто давали начало фамилиям на -ский.

Географически фамилия тяготеет к западу России. В дореволюционных источниках носители фамилии Шибатовский фиксировались в Витебской, Могилёвской и Смоленской губерниях, что подтверждает её возможное польско-белорусское происхождение. В Речи Посполитой суффикс -ский был маркером шляхты, но после разделов многие обедневшие шляхтичи переходили в мещанство или крестьянство, сохраняя фамилию.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Шибатов, Шибанов, Шибаев, — то Шибатовский стоит особняком. Те фамилии массовые, образованы напрямую от прозвищ, а Шибатовский — штучный, «географический» вариант. Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, был не просто Шибатом, а человеком, которого связывали с конкретным местом — деревней Шибатово.