Фамилия Шабатовский — относительно редкая, и её происхождение неочевидно. На первый взгляд, перед нами типичная фамилия на -ский, характерная для польской, белорусской и украинской шляхты, а также для еврейского населения этих земель. Однако корень «шабат» сразу же задаёт направление поиска.

Самая прямая и правдоподобная версия — еврейское происхождение. Основа «шабат» (ивр. שבת — суббота, день покоя) — ключевое понятие в иудаизме. Фамилия могла образоваться от названия местечка или города, где жили предки. В Восточной Европе существовали населённые пункты с корнем «Шабат»: например, Шабат (Бессарабия, ныне Молдова) или Шабац (Сербия, хотя это уже другой регион). Суффикс -овский в этом случае указывает на связь с местом: «Шабатовский» — «тот, кто из Шабатова». Такую фамилию мог получить человек, переехавший из такого селения, или же её давали целой общине по названию города.

Вторая версия — прозвищная. В славянской среде «шабат» или «шабаш» означало конец работы, отдых, а в переносном смысле — шабаш ведьм (от того же корня, но через латынь). Однако маловероятно, чтобы фамилию дали по прозвищу «Шабат» в значении «бездельник» или «колдун»: такие прозвища обычно не становились основой для фамилий на -ский, которые чаще привязывали к месту или роду занятий. Более того, в польском языке есть слово «szabat» (суббота), и фамилия могла возникнуть у еврея, которого называли «шабатовником» — человеком, соблюдающим субботу, или работающим на субботнем базаре.

Словообразовательная модель проста: корень Шабат- + суффикс -ов- (притяжательный или топонимический) + -ский (указание на принадлежность к месту или сословию). В русской традиции фамилии на -ский часто носили дворяне и духовенство, но в случае с Шабатовскими, скорее всего, речь идёт о мещанском или еврейском происхождении. В дореволюционных документах фамилия встречается в черте оседлости — на территории современной Украины, Беларуси и Польши.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шабатовский стоит в одном ряду с Шабат, Шабатин, Шабатов. Вариант на -ский выдаёт более позднее, «официальное» оформление фамилии, возможно, при получении паспорта или при переходе в христианство. В любом случае, носитель фамилии может быть уверен: его предки имели прямое отношение к субботе — либо как к дню отдыха, либо как к названию родного местечка.