Фамилия Шибченко — яркий пример украинской модели фамильного словообразования. Суффикс -енко, характерный для Поднепровья и Левобережной Украины, указывает на происхождение от предка по мужской линии: Шибченко — это буквально «сын Шибки» или «потомок Шибка». Такие фамилии закреплялись в XVI—XVII веках среди казачества и крестьянства, а затем стали самыми массовыми в украинской ономастике.

Основа фамилии — прозвище Шибка. Здесь есть два основных объяснения. Первое, самое очевидное: от глагола «шибать» — бить, ударять, кидать. В украинских говорах «шибкий» означало быстрого, резкого, а «шибнути» — ударить. Так могли прозвать драчливого человека, забияку или, наоборот, меткого охотника или камнеметателя. Второй вариант, менее заметный, но не менее вероятный: связь с диалектным «шибка» — стекло, оконный переплет. В этом случае прозвище мог получить стекольщик, торговец стеклом или человек с «прозрачным» характером.

Учитывая распространенность фамилии, можно предположить, что большинство Шибченко происходит из центральных и восточных областей Украины — Полтавщины, Черкащины, Сумщины. В XIX веке фамилия фиксируется в метрических книгах Харьковской и Екатеринославской губерний. После переселений она встречается и в южнорусских регионах, на Кубани, а позже — по всему СССР.

В русском языке фамилия устойчиво произносится с ударением на первый слог: Ши́бченко. В украинской традиции ударение может смещаться на последний слог, но это скорее исключение. Несмотря на внешнюю простоту, фамилия хранит в себе сразу два возможных портрета предка: либо вспыльчивого и резкого в движениях человека, либо мастера, работавшего с хрупким материалом.