Фамилия Шибуняева — наглядный пример того, как русский суффикс -ев присоединился к основе, которая звучит не по-русски. Сразу бросается в глаза, что фамилия образована от прозвища или имени Шибуняй. Суффикс -ев (а не -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или на -й: Шибуняй → Шибуняев → Шибуняева.

Сам корень «шиб-» в русских говорах имеет богатую историю. Глагол «шибать» означает «бросать, кидать, ударять», а в переносном смысле — «резко говорить, браниться». В диалектах «шибун» или «шибуня» — это бойкий, резкий человек, задира, скандалист. Вполне вероятно, что прозвище Шибуняй получил кто-то с таким характером. Однако не стоит исключать и более прозаичную версию: в некоторых регионах «шибуней» называли непоседу, вертлявого ребенка, который всё время «шибается» (ударяется) об углы.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий XVI–XVII веков: прозвище на -яй (сравните: Лентяй, Гуляй, Бродяй) давало фамилию с суффиксом -ев. Форма Шибуняев (а не Шибунин) подсказывает, что основа — именно Шибуняй, а не Шибуня. Встречаются и другие варианты: Шибунин, Шибунов, но Шибуняев — самый редкий и архаичный.

Географически фамилия тяготеет к северным и поволжским областям. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Шибуня в Вятской и Пермской губерниях. Это согласуется с диалектной лексикой: слово «шибуня» в значении «драчун» хорошо известно в архангельских и вологодских говорах. Социально — это почти наверняка крестьянская или посадская фамилия, без дворянских корней.

Таким образом, Шибуняева — фамилия-характеристика. Ваш предок, скорее всего, был человеком прямым, резким, не лезшим за словом в карман, а может, и просто неугомонным шалуном.