Фамилия Шигенин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — «Шигеня» — в современном русском языке не встречается, и чтобы понять, что она значила, нужно разобрать слово по частям и вспомнить, как в старину давали прозвища.

Скорее всего, в основе лежит диалектное слово «шига́» или «шига́н». В южнорусских и поволжских говорах «шигой» называли неспокойного человека, непоседу, озорника, а также того, кто подсматривает или шныряет без дела. Прозвище «Шига» мог получить бойкий, вертлявый ребёнок или, наоборот, взрослый с беспокойным характером. Уменьшительная форма «Шигеня» — это ласкательное или бытовое производное от той же основы, как «Ваня» от «Иван» или «Сеня» от «Семён». Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — «Шигенин», то есть сын, потомок Шигени.

Есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «шига» означала «шип», «колючка», и прозвище могло пристать к человеку с колючим, язвительным нравом. Но первое толкование — через характер — встречается в ономастических работах чаще и выглядит логичнее.

Географически фамилия Шигенин тяготеет к регионам, где были распространены такие диалектные слова: Нижегородская область, Чувашия, Марий Эл. По данным современных телефонных справочников, большинство носителей живут именно там, что подтверждает связь с волжскими говорами.

Фамилия эта недворянская и не книжная — она из крестьянской или мещанской среды. Её образовали по простой и древней модели: прозвище + суффикс -ин. Никакой искусственной «облагораживающей» этимологии вроде заимствований из тюркских языков для неё не нужно — всё объясняется живой русской речью. Если ваш предок носил фамилию Шигенин, то, скорее всего, он был потомком человека, которого в деревне запомнили как бойкого, юркого или не в меру деятельного.