Фамилия Шигонин образована от прозвища или нецерковного имени Шигона. Её основа — древнерусское слово «шигоня», которое в разных говорах означало «баловник», «проказник», «шалун» или «повеса». В словаре Владимира Даля у слова «шигать» есть значение «шалить, проказничать», а «шигона» — это тот, кто этим занимается. Таким образом, предок носителя фамилии, скорее всего, получил прозвище за живой, озорной нрав.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шигонин — буквально «сын Шигоны» или «человек из семьи Шигоны». Эта модель типична для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я. В отличие, например, от фамилий на -ов/-ев, которые чаще возникали от основ на согласный. Шигонин — фамилия недворянская, крестьянская или мещанская по происхождению, что подтверждается и её «прозвищной» природой.

Интересно, что в исторических документах XVI–XVII веков встречается имя Шигона. Например, известен боярский сын Иван Шигона, служивший при дворе Василия III. Но это имя, скорее всего, было прозвищем, а не крестильным. Впрочем, фамилия Шигонин могла закрепиться и от этого конкретного лица, если его потомки взяли фамилию по отцу. Однако более вероятно, что фамилия возникала независимо в разных местностях от одного и того же прозвища.

Географически фамилия Шигонин встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в бывших Вятской, Костромской и Вологодской губерниях. Это указывает на её исконно русское, севернорусское происхождение. В некоторых говорах тех мест «шигона» могло означать не просто шалуна, а ещё и «вертлявого, непоседливого человека» — оттенок, который усиливает характеристику предка.

Редкий суффикс -ин в сочетании с основой на -а делает фамилию Шигонин легко узнаваемой. Среди однокоренных фамилий — Шиганов, Шигаев, Шигин. Но Шигонин стоит особняком: если Шиганов могло произойти от тюркского имени Шигай, то Шигонин — стопроцентно русское образование от славянского корня. Так что носитель фамилии может быть уверен: его предок был человеком с характером, не чуждым шалостей, а сама фамилия — живое напоминание о бытовом языке Древней Руси.