Фамилия Шиголакова — редкая и с непрозрачной, на первый взгляд, основой. Она явно тюркского происхождения, и её разбор требует обращения к языкам Поволжья и Кавказа, где встречаются похожие корни.

В основе фамилии лежит мужское прозвище или имя Шиголак. Первая часть, «шиго-», скорее всего, восходит к тюркскому «шик» или «шиг» — в разных диалектах это может означать «больной», «хилый» или, наоборот, «крепкий», «здоровый» (значение зависит от конкретного языка и огласовки). Вторая часть, «-лак», — распространённый тюркский суффикс, образующий имена и прозвища (как в фамилиях Байлаков, Кушлаков). Таким образом, Шиголак — это человек, которого охарактеризовали по состоянию здоровья или внешнему виду: возможно, «крепкий, коренастый» или, напротив, «болезненный, щуплый». Более точное значение можно установить только при знании конкретного диалекта предков.

Суффикс «-ов» в окончании (женская форма — «-а») — стандартный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — Шиголаков, то есть потомок Шиголака. Фамилия сформировалась в русской языковой среде, когда тюркское прозвище оформили по русской модели, что типично для фамилий, возникших в среде татар, башкир, чувашей или ногайцев, перешедших на русский язык.

Географически фамилия Шиголакова тяготеет к регионам с сильным тюркским субстратом: вероятнее всего, к Астраханской области, Дагестану или Оренбуржью. Встречается она и у казахов, где форма «Шығалақ» могла означать «выступающий, видный» (от глагола «шығу» — выходить). Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным русским словом «шигола» — так в некоторых говорах называли бойкого, вертлявого человека. Но тюркская этимология выглядит убедительнее, учитывая структуру корня.

Фамилия не входит в число распространённых, поэтому её носители — это, скорее всего, потомки одного или нескольких родов, сохранивших память о прозвище предка. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и казаками или мещанами — точных данных нет, но тюркская основа указывает на то, что род, вероятно, вышел из среды, где бытовали местные языки и обычаи.