Фамилия Шилим, предположительно, образована от аналогичного имени, которое является фонетическим вариантом имени Селим. Оно в переводе с арабского языка на русский означает «здоровый». Вероятно, родители назвали сына именем Шилим, желая, чтобы он вырос крепким и сильным. Можно предположить, что оно этимологически связано с идишским нарицательным «шильмовер», которое означает «стена синагоги» (от идишского «шиль» – «синагога»). Вероятно, Шилимом прозвали того, кто чтил все еврейские традиции и регулярно посещал синагогу. Также не исключено, что Шилимом именовали ученого раввина. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.