Фамилия Шилимина — женская форма фамилии Шилимин, и её происхождение неочевидно с первого взгляда. Корень «шил-» сразу наводит на мысль о глаголе «шить» или существительном «шило». Однако суффикс «-имин» (а не привычные «-ов» или «-ин») встречается редко и указывает на особую модель образования, характерную для некоторых русских говоров, особенно северных и сибирских.

Скорее всего, в основе фамилии лежит прозвище Шилима или Шилим. В русских диалектах слово «шилим» могло означать непоседливого, вертлявого человека или того, кто постоянно «шьёт» — то есть занимается каким-то мелким, кропотливым делом. Есть и другая версия: прозвище могли дать по инструменту — шилу, но с уменьшительным или пренебрежительным оттенком. В таком случае Шилима — человек, который «как шило», острый на язык или беспокойный.

Модель образования «Шилим + -ин» — типичная для русских фамилий, отвечающих на вопрос «чей?»: сын Шилимы. Суффикс «-имин» возник из-за того, что основа оканчивается на мягкий согласный «м», и при присоединении «-ин» гласный «а» в конце прозвища выпал (Шилима → Шилимин). Это отличает фамилию от более массовых «-ов» и «-ев», но встречается в старых крестьянских и посадских родах.

Географически фамилия Шилимин (и Шилимина) привязана к центральным и северным областям России. Встречается в документах XVII–XVIII веков в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях. Там же фиксируются однокоренные фамилии — Шилин, Шилов, но Шилимин стоит особняком из-за редкого суффикса, который мог возникнуть в условиях местного говора, где «а» после мягких согласных переходила в «и».

Таким образом, предки носительницы фамилии Шилимина — скорее всего, крестьяне или ремесленники из северной или центральной России, получившие прозвище по характеру или занятию. Фамилия недворянская, не искусственная, а народная, что делает её ценной для изучения локальной русской ономастики.