Фамилия Шилке — редкий случай в русском ономастиконе, и её разбор требует осторожности. Скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия, а германизированная или полонизированная форма, что сразу отличает её от типичных фамилий на -ов, -ин или -ский.

Наиболее вероятная версия: Шилке — это вариант немецкой фамилии Schilke. В немецком языке основа «Schilf» означает «тростник» или «камыш». Суффикс «-ke» — характерный уменьшительный или патронимический формант в восточно-немецких и силезских диалектах (ср. Schilke — «маленький тростник» или «сын того, кто живёт у камыша»). Фамилия могла попасть в Россию вместе с переселенцами-колонистами при Екатерине II, а затем обрусела на письме, потеряв букву «c» и получив окончание, типичное для русского склонения.

Вторая версия, менее распространённая, но возможная для западных регионов бывшей Речи Посполитой: польское происхождение от слова «szyłka» (производное от «szyć» — шить). В таком случае Шилке могло быть прозвищем портного или швеи. Однако польская фамилия обычно писалась бы как Szyłka или Szylko, а форма Шилке ближе к немецкой фонетике.

Географически фамилия встречается в основном в Волгоградской, Саратовской областях и в Сибири — там, где компактно селились немецкие колонисты. Если ваши предки были из Поволжья, версия с немецкими корнями почти наверняка верна. Если же родом из Беларуси или Украины, стоит проверить польский след.

Что касается суффикса: в русском языке фамилия Шилке не имеет типичного окончания -ов или -ин, что указывает на её иноязычное происхождение и более позднюю фиксацию в документах. В дореволюционных метриках немцев-колонистов фамилия могла писаться как Шильке или Шилкэ.