Фамилия Шилка — редкий случай, где трудно сразу сказать, что перед нами: географическое название, прозвище или профессия. В русской ономастике она стоит особняком, потому что её основа не вписывается в стандартные модели крестьянских или дворянских фамилий.

Самый очевидный путь — связать Шилку с гидронимом: река Шилка в Забайкалье, левая составляющая Амура. Но здесь важно не торопиться. Фамилия, образованная от названия реки, обычно давалась переселенцам, которые уходили за Урал и получали прозвище по месту нового жительства. Однако Шилка как фамилия встречается и в центральных губерниях России, где о забайкальской реке могли и не знать. Значит, корень глубже.

Вероятнее всего, в основе лежит прозвище Шилка от глагола «шить» или существительного «шило». В русских говорах «шилка» — это уменьшительное от «шило», мастеровой инструмент сапожника или портного. Человек, получивший такое прозвище, мог быть портным, сапожником или просто острым на язык (шило — символ колкости, бойкости). Суффикс -к- здесь не фамильный (как -ов или -ин), а уменьшительно-прозвищный: Шилка — это не «сын Шила», а сам человек, названный так в обиходе. Такие бессуффиксные фамилии — редкость, они характерны скорее для украинской или белорусской традиции, но встречаются и в русской среде, особенно на юге и западе.

Есть и третья версия, более спорная: от тюркского «шил» (болезнь, паралич) или калмыцкого «шилк» (шёлк). Но она слабая: для фамилии, закрепившейся в русском языке, проще предположить славянскую основу, чем искать экзотические корни без письменных подтверждений.

Что касается географии: Шилка не массовая фамилия. Встречается в Сибири (что логично из-за реки), на Урале и в Поволжье. Социальный состав — в основном крестьяне и мещане, без следов дворянства. Фамилия не склонялась по падежам как типичная русская (Шилка, Шилки, Шилке), что тоже указывает на её прозвищное, а не патронимическое происхождение.

Итог: Шилка — скорее всего, прозвище мастера-портного или сапожника, закрепившееся как фамилия без добавления суффикса принадлежности. Если предки жили в Забайкалье, возможно, фамилия пошла от реки, но для центральной России версия с шилом и шитьём надёжнее.