Фамилия Шилковников образована от прозвища Шилковник. Согласно одной из версий, в основе этого прозвища лежит корень глагола «шить». Соответственно, предок обладателя этой фамилии был портным, за что и получил прозвище Шилковник. Русские портные в XIX веке нередко ездили совершенствовать свое мастерство в Лондон или Вену в портновские школы. В XIX веке подобных изданий было множество — с 1834 года выходил журнал «Библиотека для чтения» с модными картинками, с 1836 года — «Современник» и «Московитянин». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шилковник, со временем получил фамилию Шилковников.