Фамилия Шинякина образована по самой распространённой в русской ономастике модели — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Шинякин, то есть сын или потомок Шиняки. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Шиняка. Разберём, что могло стоять за этим словом.

Корень «шин-» отсылает к глаголу «шинять» — в южнорусских и украинских говорах это означало «шипеть», «издавать глухой звук», а также «браниться», «ворчать». Прозвище Шиняка могли дать человеку с хриплым или сиплым голосом, либо тому, кто постоянно выражал недовольство, брюзжал. В некоторых диалектах «шиня» означало «нечто шипящее, змея» — не исключено, что прозвище носило ироничный или охранительный характер (чтобы злые силы не тронули ребёнка, его называли «змеёнышем»).

Менее вероятна, но возможна связь с украинским «шинь» — «шина», «обод колеса». В этом случае Шиняка — прозвище мастера, который делал ободья или занимался колёсным ремеслом. Однако такая версия слабее: слово «шина» в значении «обод» закрепилось в русских говорах поздно, и фамилии от него образовывались бы через суффикс -щик (Шинщиков), а не через -як/-яка.

Фамилия Шинякина — женская форма, мужская — Шинякин. Географически она встречается преимущественно в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской, Курской и Белгородской областях, что подтверждает южнорусское происхождение основы. Встречается и в украинских фамилиях (Шиняка, Шиняк), но в русском варианте закрепился именно суффикс -ин.

Сословного барьера у фамилии не было: её могли носить как крестьяне, так и мещане. В документах XVIII–XIX веков Шинякины числятся среди однодворцев (особая категория южнорусского населения, сочетавшая черты крестьян и мелких землевладельцев). Таким образом, фамилия Шинякина — яркий пример того, как диалектное слово, описывающее голос или характер, стало родовым именем, сохранившим память о далёком предке-«ворчуне» или обладателе сиплого голоса.