Фамилия Шипильгинов — одна из тех редких русских фамилий, в которых слышен говорок, а не книжное правило. Её основа — не имя и не профессия, а прозвище, и разобраться в нём помогает не столько словарь, сколько живая диалектная лексика.

Скорее всего, в основе лежит слово «шипильга» или «шипильгин» — так в некоторых северных и сибирских говорах называли человека с острым языком, язвительного, колкого. Корень здесь тот же, что и в слове «шипеть»: прозвище давали не за внешность, а за характер — за манеру говорить едко, с подковыркой. Модель образования типична для русских фамилий на -ин: прозвище на -а или -я (Шипильга) дало притяжательную форму «чей?» — Шипильгин, а потом, вероятно, появился и более полный вариант Шипильгинов, который встречается реже и звучит как отчество. Суффикс -ов здесь вторичен, он мог возникнуть при переоформлении фамилии в официальных документах или под влиянием более распространённой модели.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с диалектным «шипиль» — заноза, щепка. В этом случае прозвище могло относиться к человеку худощавому или дотошному, «приставучему». Но первая гипотеза — про острый язык — кажется убедительнее, потому что для прозвищ, характеризующих речь, в русской ономастике есть целый ряд параллелей (Крикунов, Балабонов, Верещагин).

Географически фамилия Шипильгинов редкая и привязана в основном к северным регионам — Вологодской, Архангельской областям, а также к Пермскому краю, куда переселенцы принесли северный говор. Встречаются также варианты написания с одной «л»: Шипильгин, Шипигин — но это уже результат упрощения в устной речи или при записи в метриках.

Сословной привязки у фамилии нет: её носители могли быть и крестьянами, и мещанами. Главное, что она сохранила живую черту характера предка — колкость и остроту языка, которая, судя по всему, запомнилась окружающим и закрепилась в родовом имени.