Фамилия Шишилова — женская форма от Шишилов, а та, в свою очередь, восходит к прозвищу Шишила. В русских говорах слово «шиш» имело целый веер значений, и почти все они нелестные: мелкий бес, чертёнок, нечистая сила, а также вор, мошенник, бродяга или лазутчик. Отсюда и «шишига» — кикимора или болотный дух. В словаре Даля «шишила» — это ещё и беспокойный, суетливый человек, непоседа. Таким образом, прозвище Шишила, скорее всего, давали человеку с неспокойным нравом, либо тому, кого считали плутоватым и изворотливым.

Модель образования фамилии проста: к основе на -а добавился патронимический суффикс -ов, типичный для северных и центральных русских земель. Шишилов — буквально «сын Шишилы». В документах фамилия встречается с XVII века. Например, в переписных книгах Воронежского уезда 1646 года упомянут крестьянин Ивашка Шишилов, а в 1678 году — бобыль Федька Шишилов в Каширском уезде. Это указывает на то, что фамилия бытовала в среде крестьян и посадских людей, а не в дворянской среде.

Географически фамилия Шишилов/Шишилова рассредоточена по всей России, но заметные очаги — Воронежская, Тульская, Рязанская области и Поволжье. Интересно, что в некоторых диалектах «шишила» означало не только чертёнка, но и длинный, торчащий предмет — например, кол или шип. В этом случае прозвище могло относиться к высокому, худощавому человеку с резкими чертами.

Редкий суффикс -ил- в основе (Шиш-ил-а) не типичен для русских прозвищ, что делает фамилию заметной на фоне более распространённых Шишов, Шишкин или Шишаков. Если ваши предки — Шишиловы, скорее всего, они происходят из среды вольных или крепостных крестьян центральной России, а прозвище родоначальника отражало либо его непоседливый характер, либо внешнюю особенность.