Фамилия Шишимирова образована от прозвища Шишимир. Оно восходит к диалектному нарицательному «шишимор». В старину так называли «злой дух, нечистую силу», а также «черта и лешего». В данном случае, надеясь иметь здорового и красивого мальчика, родители назвали его Шишимиром. Кроме того, «шишимором» называли «нелепого, смешного человека». В таком случае, возможно, что прозвище содержало указание на особенности поведения предка. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, это прозвище имеет тюркское происхождение и образовано от корня «șyș» («шыш») – «опухоль, опухлость». В этом случае Шишимиром могли прозвать полного человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шишимир, со временем получил фамилию Шишимирова.