Фамилия Шишляников с первого взгляда кажется производной от слова «шишка», но это не совсем так. Вернее, не только так. Основа здесь — «шишляник», а это не просто шишка, а конкретный предмет: так в русских говорах называли большую деревянную колотушку, пест, которым толкли что-то в ступе, или же просто увесистую дубину. Человек, получивший прозвище Шишляник, мог быть плотником, делавшим такие колотушки, либо же его так окрестили за крепкое телосложение или грубоватый нрав — мол, здоровенный, как дубина.

Суффикс «-ов» в окончании фамилии типичен для центральной России и указывает на принадлежность: «чей сын?» — Шишляников, то есть потомок Шишляника. Модель образования простая и частая для крестьянских и мещанских фамилий XVII–XIX веков, когда прозвище отца закреплялось за детьми в виде притяжательного прилагательного.

Любопытно, что слово «шишляник» имеет и второе, менее известное значение — так в некоторых областях называли растение шиповник. Вряд ли прозвище давали за любовь к ягодам, но исключать вариант, что предок жил у зарослей шиповника или торговал сушёными плодами, полностью нельзя. Однако первая версия — с колотушкой — надёжнее, поскольку прозвища по орудиям труда и физическим качествам встречаются в русской ономастике гораздо чаще, чем «растительные».

Географически фамилия Шишляников тяготеет к Поволжью и северо-восточным областям России — встречается в старых переписях Вятской, Нижегородской и Костромской губерний. В этих краях слово «шишляник» в значении «пест» было в ходу у местных крестьян. Аристократического происхождения у фамилии нет: это типичная фамилия крестьянского или посадского сословия, образованная от бытового прозвища.

Отдельно стоит заметить, что в написании фамилии иногда путают суффикс: встречается вариант Шишлянников — с двойной «н». Это ошибка, возникшая под влиянием более распространённых фамилий вроде Шишков или Шишанов, но исторически верная форма — с одной «н», так как суффикс «-ник» даёт одну букву, а «-ов» добавляется уже к основе.