Фамилия Шишлянников образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Шишлянников происходит от прозвища Шишлянник, в основе которого лежит глагол «шишлять» - «копаться над чем-либо, мешкотно делать». Таким образом, прозвище Шишляник мог получить медлительный, нерасторопный человек. Нельзя также исключить связь этого прозвища с тюркскими словами sis – «вертел», или sislik – «пригодный для шашлыка». В этом случае прозвище Шишляник могло указывать на род занятий предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шишлянник, со временем получил фамилию Шишлянников. О точном месте и времени возникновения фамилии Шишлянников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шишлянников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.