Фамилия Шишонков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Шишонков послужило мирское имя Шишонок. Скорее всего, фамилия Шишонков образована от нецерковного имени Шишонок, в основе которого лежит слово «шиш». В славянской мифологии Шиш — нечистая сила, живущая обычно на обочинах и играющая свадьбы свои, когда на проезжих дорогах вихри поднимаются столбом. Славяне представляли, что голова шиша с кулачок, нос длинный и вертлявый. К «шишам» посылали в гневе докучных или неприятных людей. Вероятно, именование Шишонок представляло собой «охранительное» имя. Славяне считали, что нечистая сила не тронет ребенка, носящего одно с ней имя. В данном случае, надеясь иметь красивого и здорового мальчика, родители назвали его Шишонок. Однако нельзя исключить, что фамилия Шишонков произошла от прозвища. Возможно, в его основе лежало слово «шишоня», которым в вятских говорах обозначали тихоню, нерасторопного, вялого человека. А шишом в старину называли заостренную верхушку чего-либо, остроконечный или стоящий торчком предмет. Следовательно, прозвище Шишонок мог получить высокий или гордый человек. Таким образом, фамилия Шишонков может содержать указание на внешние особенности или характер предка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Шишонок, со временем получил фамилию Шишонков. О точном месте и времени возникновения фамилии Шишонков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шишонков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.