Прозвище Шишоня образовано от аналогичного диалектного слова, которым в вятских говорах обозначали тихоню, нерасторопного, вялого человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шишоня, со временем получил фамилию Шишонин.