Фамилия Шишотов — одна из тех русских фамилий, чей корень лежит не в церковном имени, а в прозвище, которое могло звучать и обидно, и уважительно одновременно. Основа здесь — «шиш», слово, имеющее на Руси несколько значений. Первое и самое древнее — «острый предмет», «кол», «шип», отсюда же и «шишка». Второе, прозвищное — «плут», «мошенник», «вор», а в некоторых говорах так называли бродягу или лазутчика. Третье, более безобидное — «торгаш», «мелочный торговец», «офеня» (коробейник). Вряд ли стоит искать здесь связь с матерной лексикой: в основе фамилии лежит старое, бытовое слово.

Суффикс «-ов» указывает на типичную русскую патронимическую модель: Шишотов — буквально «сын Шишота». А вот само имя Шишот — это уменьшительно-ласкательная или уничижительная форма от прозвища Шиш. Такие формы на «-от» в русском языке редки, но встречаются (сравните: Бобот, Косот). Они характерны для северных и северо-восточных говоров, где любили «усекать» имена и прозвища, добавляя экспрессивные суффиксы. Таким образом, Шишот — это не просто «маленький Шиш», а скорее «Шиш, которого мы знаем и к которому привыкли», нейтральное или даже фамильярное обращение.

Географически фамилия Шишотов не слишком распространена. Основные очаги — Вологодская, Архангельская области и Вятка (Кировская область). Именно в этих регионах слово «шиш» в значении «плут» или «бродяга» было в ходу, и именно там бытовала модель образования прозвищ на «-от». Например, в вологодских писцовых книгах XVI–XVII веков можно встретить крестьян с прозвищем Шиш, а позже и их детей — Шишотовых. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, черносошными (свободными) крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами.

Можно рассмотреть и альтернативную, менее вероятную версию. В некоторых тюркских языках существует имя Шиш (от «опухоль», «шишка») или слово «шиш» — «шампур», «вертел». Однако фамилия Шишотов — с чисто русским суффиксом «-ов» и уменьшительным «-от» — явно славянского происхождения. Тюркская версия была бы возможна, если бы фамилия звучала как Шишов или Шишаев, но не Шишотов.

Итак, основная версия: прозвище Шиш (плут или торговец) → уменьшительное Шишот → фамилия Шишотов. Предки — крестьяне или ремесленники Русского Севера, люди с неспокойным характером или, наоборот, сметливые торговцы. Фамилия редкая, но выразительная — она хранит в себе живую речь и социальный портрет человека прошлого.