Фамилия Шкапова — женская форма фамилии Шкапов, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или профессией предка. В основе лежит слово «шкап» — устаревший вариант слова «шкаф». В русских говорах «шкапом» называли не только предмет мебели, но и человека: либо того, кто был плотным, коренастым, «как шкаф», либо, напротив, того, кто занимался изготовлением шкафов — столяра-краснодеревщика. Таким образом, первый носитель фамилии мог получить прозвище за внешность или по роду занятий.

Модель образования проста и типична для русского севера и центра: к основе «Шкап» добавился патронимический суффикс «-ов», указывающий на принадлежность («чей?» — Шкапов). Фамилия фиксируется в основном в южнорусских и поволжских регионах, что косвенно подтверждает её связь с плотницким ремеслом: в этих краях было развито строительство из дерева, и мастеров-шкапников ценили. Встречаются также однокоренные фамилии Шкапин, Шкапкин, Шкапский, но Шкапов — самая распространённая из них.

Любопытная деталь: в некоторых говорах слово «шкап» имело переносное значение — «скупой, прижимистый человек» (от фразы «всё в шкап прячет»). Однако эта версия менее убедительна: прозвища по чертам характера в русской ономастике обычно образуются через суффиксы -ух, -юх, -яй, а не через прямую номинацию. Скорее всего, Шкаповы — потомки мастеровых людей, столяров или краснодеревщиков, которые в XVIII–XIX веках работали в городах и сёлах, где был спрос на добротную мебель.

Источники по фамилии скудны: она не упоминается в основных работах Б. Унбегауна и В. Никонова, что говорит о её локальном распространении. В метрических книгах XIX века Шкаповы встречаются в Тамбовской и Саратовской губерниях, изредка — на Дону. Фамилия не дворянская, не купеческая — типично крестьянская или мещанская, с ясным ремесленным следом.