Фамилия Шкапин образована от прозвища Шкапа, которое ведет свое начало от украинского «шкапа» — «заморенный, слабосильный, худой конь», «кляча». Возможно, Шкапой прозвали человека, который все силы отдавал работе. Кроме того, шкапой в некоторых диалектах называли орла. Поэтому не исключено, что Шкапа являлось не прозвищем, а мирским именем. Давая младенцу такое имя, как Шкапа, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного мира. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шкапа, со временем получил фамилию Шкапин.