Фамилия Шкитов — одна из тех, где исходное слово почти исчезло из живого языка, а сама фамилия осталась. Разберёмся по порядку.

В основе фамилии лежит слово «шкит». В русских говорах, особенно северных и сибирских, шкитом называли мелкую рыбёшку, малька или вообще небольшую рыбку, непригодную для серьёзного улова. Прозвище Шкит могли дать невысокому, худощавому человеку — по аналогии с маленькой рыбой. Вторая, менее распространённая версия: в некоторых говорах «шкит» означало «плохой, дрянной человек» (отсюда же глагол «шкитаться» — скитаться, болтаться без дела). В этом случае прозвище носило бытовую, нелестную характеристику.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Шкитов буквально значит «сын Шкита» или «из рода Шкита». Фамилия образована от прозвища, а не от крестильного имени, поэтому её носитель в XV–XVII веках мог быть крестьянином или посадским человеком, получившим уличное прозвище по внешности или поведению.

Географически фамилия Шкитов встречается преимущественно на Русском Севере — в Архангельской, Вологодской областях, а также в Сибири, куда переселенцы принесли северные говоры. В центральных и южных регионах она редка. Это косвенно подтверждает связь с северной диалектной лексикой.

Родственных фамилий немного: Шкитин (от той же основы, но с другим суффиксом) и Шкитко (украинская или белорусская форма). Если встречается вариант Шкитовский — это уже польская или западнорусская модель, образованная от названия местечка или усадьбы, но это совсем другая история.

Таким образом, предок современных Шкитовых — скорее всего, невысокий или незнатный человек, которого в деревне прозвали Шкитом за сходство с мелкой рыбёшкой или за непостоянный образ жизни. Фамилия сохранила в себе слово, которое сегодня почти никто не употребляет, но которое сто-двести лет назад было обычным в крестьянском быту.