Фамилия Шкитова — женская форма от фамилии Шкитов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Шкит. Основа здесь не самая очевидная для современного уха, и сразу возникает вопрос: что или кто такой «шкит»?

Самый прямой путь — к диалектному слову «шкит», которое в ряде русских говоров (особенно северных и сибирских) означало «скит», то есть небольшое поселение монахов или старообрядческий монастырь. В этом случае прозвище Шкит могли дать человеку, жившему в скиту, либо выходцу из такого поселения. Связь со старообрядчеством здесь вполне реальна: носители фамилии встречаются в регионах, где были сильны староверческие общины — на Урале, в Поморье, в Сибири.

Есть и более бытовая версия. В некоторых говорах «шкит» — это пренебрежительное название хитрого, пронырливого человека, а то и мелкого воришки. Слово могло быть заимствовано из уголовного арго, где «шкит» означал «убежище» или «притон», а затем перешло на человека, который в таких местах ошивается. Однако эта версия менее распространена в ономастике, чем первая, и скорее всего, возникла позже.

Суффикс -ов в основе указывает на типичную русскую патронимическую модель: Шкитов — сын Шкита. Фамилия не относится к числу древних дворянских, а скорее крестьянская или посадская, что подтверждается её бытованием в среде простых людей. Встречается она неравномерно: по данным современных телефонных справочников и баз, наибольшая концентрация Шкитовых зафиксирована в Кировской области, Пермском крае и на Урале. То есть там, где исторически селились старообрядцы и где диалектное слово «шкит» было в ходу.

Таким образом, фамилия Шкитова, скорее всего, указывает на предка, который либо жил в скиту, либо происходил из старообрядческого поселения. Второе значение — прозвище по характеру — возможно, но менее вероятно для ранних этапов формирования фамилий в XV–XVII веках.