Фамилия Шкурагина — женская форма фамилии Шкурагин, и образована она по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Шкурагин — это «сын Шкураги», а Шкурагин, в свою очередь, происходит от прозвища или мирского имени Шкурага. В основе лежит слово «шкура», но не в современном бытовом значении «кожа животного», а в более широком, древнерусском. В говорах «шкурой» могли называть не только содранную кожу, но и скупого, жадного человека («шкура» — скряга), либо, наоборот, хитрого и пронырливого. Есть и другая, менее распространенная версия: в некоторых диалектах «шкурага» — это вид растения или корявое, неровное дерево, и прозвище могли дать человеку с некрасивой, морщинистой кожей или просто невысокому и коренастому.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: основа «шкур-» + суффикс -аг- (как в словах «бродяга», «растяпа»), который придавал прозвищу оттенок пренебрежения или шутливой характеристики. Затем к основе Шкураг- добавился типичный русский фамильный суффикс -ин. Фамилия довольно редкая, и её география, скорее всего, связана с центральными и южнорусскими областями, где активно бытовали прозвища на -ага/-яга. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли даваться по отцу-крестьянину или ремесленнику, фамилии на -ин часто возникали в среде служилых людей и крестьян, но сословной границы здесь нет — в XVIII–XIX веках такую фамилию мог получить кто угодно, если его предка прозвали Шкурой или Шкурагой.

Интересно, что фамилия Шкурагин не имеет никакого отношения к украинской или белорусской фамилии Шкура (где ударение на последний слог и значение «шкура» как материал). Русская версия с суффиксом -ага и ударением, скорее всего, на второй слог (ШкурАга) — это именно прозвищная модель, типичная для великорусских говоров. В ономастических справочниках фамилия не упоминается среди самых частых, но её прозрачная семантика позволяет уверенно говорить о происхождении от личного прозвища, которое закрепилось за основателем рода. Если ваш предок носил фамилию Шкурагин, он наверняка был потомком человека, которого в деревне знали как Шкурагу — возможно, за бережливость, доходящую до скупости, или за цепкий, хваткий характер.