Фамилия Шлюпкина — женская форма фамилии Шлюпкин. В основе фамилии лежит слово «шлюпка» — небольшое гребное или парусное судно. Казалось бы, логично связать фамилию с ремеслом лодочника или корабела, но в русской ономастике не всё так прямолинейно. Слово «шлюпка» — заимствование из голландского sloep, которое вошло в русский язык в петровскую эпоху, когда массово осваивалась морская терминология. Однако фамилия Шлюпкин могла возникнуть и раньше, если её корень — не «шлюпка», а диалектное или прозвищное слово.

Более правдоподобная версия — связь с прозвищем Шлюпка. В русских говорах «шлюпка» могло означать не только судно, но и нечто шаткое, ненадёжное или, наоборот, юркое, подвижное — в зависимости от контекста. Такое прозвище могли дать человеку за особенности походки, поведения или внешности. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шлюпкин — сын или потомок человека по прозвищу Шлюпка.

Интересно, что в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от названий профессий или имён на согласный, суффикс -ин типичен для основ на -а/-я. Это делает фамилию Шлюпкин типичной для северных и центральных областей России, где такая модель распространена. Географически фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её прозвищное, а не «морское» происхождение: вдали от крупных портов слово «шлюпка» вряд ли было бы повсеместным.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шлюпников, Шлюпочкин — показывает, что все они образованы от одной основы, но с разными суффиксами. Шлюпкин — самая краткая форма, что говорит о древности прозвища: чем короче фамилия, тем выше вероятность, что её основа — личное прозвище, а не позднее искусственное образование. Таким образом, носитель фамилии Шлюпкин, скорее всего, потомок человека, которого в деревне прозвали Шлюпкой за какую-то заметную черту, а не за связь с мореходством.