Фамилия Шмуглякова образована от мужского варианта Шмугляков, а тот, в свою очередь, — от прозвища или нецерковного имени Шмугляк. Основа здесь — корень «шмугл-», который в русских говорах имеет несколько значений, и это как раз тот случай, когда география бытования фамилии подсказывает верный вариант.

Самый вероятный источник — южнорусские и украинские говоры, где «шмугляк» или «шмуглый» означало «смуглый, темнокожий, чернявый». В этом случае фамилия давалась по внешнему признаку: человек с тёмной кожей или тёмными волосами. Суффикс -як в прозвище типичен для украинской и южнорусской антропонимии (сравните: дурняк, веселяк), а затем фамилия оформилась по русской модели с суффиксом -ов, указывающим на принадлежность: «сын Шмугляка».

Менее распространённая, но возможная версия связывает корень с диалектным глаголом «шмуглять» — «хитрить, лукавить, обманывать». В таком случае Шмугляком называли не прямого, а изворотливого человека. Однако эта гипотеза слабее, так как глагол встречается реже, чем прилагательное со значением цвета.

Фамилия Шмуглякова — довольно редкая. Её географическое ядро, судя по современным данным, находится в южных областях России (Ростовская, Волгоградская области) и на востоке Украины. Это косвенно подтверждает первую версию: именно в этих регионах, где смешались русские и украинские говоры, слово «шмуглый» было в ходу. В северных и центральных областях России фамилия почти не встречается.

В написании фамилии обращает на себя внимание начальное «шму-», а не «шмуг-» в корне. Это результат фонетического стяжения: в прозвище «Шмугляк» согласный [г] перед суффиксом -ляк мог выпадать или оглушаться, а в фамилии закрепилось то произношение, которое было в живой речи. Поэтому не стоит искать связи с немецким «Schmuck» (украшение) или еврейскими корнями — это чисто славянская фамилия, образованная от местного диалектного слова.