Фамилия Шоган — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. В ней нет типичного русского суффикса принадлежности (-ов, -ев, -ин), что сразу указывает: перед нами не «чей-то сын», а скорее прозвище, застывшее в форме, или фамилия, пришедшая из другого языка.

Самая вероятная версия связывает Шоган с тюркскими корнями. В тюркских языках «шог» или «чог» означает «огонь», «жар», «пыл». Соответственно, «шоган» могло быть прозвищем горячего, вспыльчивого человека или, наоборот, того, кто работал с огнём — кузнеца, плавильщика. В пользу этой гипотезы говорит и географическая привязка: фамилия встречается у кубанских казаков, в среде которых было много выходцев из южнорусских степей, контактировавших с тюркским населением.

Вторая версия — молдавская или румынская. В румынском языке «şoim» (произносится «шойм») значит «сокол», а «şoiman» — «соколёнок», «ловчий сокол». Фамилия Шоган может быть фонетическим вариантом от «Шойман» или «Шойган», закрепившимся в Бессарабии. Тогда предок носителя был сокольником, охотником с ловчей птицей или человеком с острым, «соколиным» взглядом.

Есть и более спорное предположение — от еврейского имени Шоган (вариант имени Иегошуа, Иешуа), но эта версия не имеет массового подтверждения в словарях и встречается лишь единично.

Модель образования фамилии простая: чистый корень без суффикса и окончания. Это характерно для прозвищ, которые перешли в фамилии без изменений (сравните: Токарь, Гончар, Коваль). В русской среде такую форму часто давали людям нерусского происхождения, либо она сохранилась в малограмотной среде, где паспортисты записывали фамилию «как слышали».

Итог: Шоган — скорее всего, прозвище по характеру (пылкий, горячий) или по профессии (кузнец, сокольник). Точный ответ дала бы только генеалогия конкретной семьи, но тюркский след выглядит убедительнее других.