Фамилия Шоганова — женская форма от Шоганов. В основе фамилии лежит, скорее всего, тюркское мужское имя Шоган. Оно образовано от слова «шог» (радость, веселье) с уменьшительным суффиксом -ан. Таким образом, Шоган — это «радостный», «веселый». Фамилия, по этой версии, означает «потомок Шогана» и относится к распространенному типу русских фамилий, образованных от прозвищ или имен тюркского происхождения.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с русским диалектным словом «шоган» — так в некоторых говорах называли высокий стебель травы, бурьян. В этом случае прозвище Шоган мог получить высокий и худой человек. Однако тюркская этимология выглядит убедительнее, поскольку фамилия распространена в регионах с сильным татарским и башкирским влиянием — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области.

Суффикс -ов (в мужском варианте) указывает на принадлежность к роду. Фамилия Шогановых, скорее всего, не принадлежала дворянскому сословию: такие фамилии чаще всего носили крестьяне, мещане или служилые люди из татарских и башкирских родов, перешедшие в православие и получившие фамилию по имени предка.

В архивных записях фамилия встречается с XVIII века. Например, в ревизских сказках Оренбургской губернии упоминаются крестьяне Шогановы, что подтверждает её «низовое» происхождение. Интересно, что фамилия могла закрепиться в двух вариантах ударения — на первый или на второй слог, что иногда путает исследователей.

Таким образом, носительница фамилии Шоганова может с большой вероятностью считать своими предками выходцев из тюркской среды, получивших фамилию по имени родоначальника, означавшему «радость».