Фамилия Шолыгин образована от прозвища Шолыга. Оно ведет свое начало от диалектного нарицательного «шалыга» - «плешь, темя». Вероятно, прозвище Шолыга содержало указание на особенности внешности основателя фамилии (лысина на голове). Кроме того, во владимирских говорах слово «шалыга» имело значение «посох с загнутым верхним концом», а в костромских – «плеть, кнут». В таком случае прозвище Шолыга, скорее всего, относится к числу «профессиональных именований, содержащих указание на род деятельности предка: он мог быть пастухом или погонщиком. Возможно также, что прозвище Шолыга восходит к известному в Забайкалье глаголу «шалыганить» — «шутить, смеяться». В таком случае Шолыгой могли прозвать веселого, забавного, озорного человека. Веселовского записаны родственные именования: Иван Шелыга, земский целовальник на Белоозере (1559 г.), Дмитрий Шелыгин, крестьянин (1624 г., Курмыш), а также Шелыгин Белка (1550 г., Пошехонье). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шолыга, со временем получил фамилию Шолыгин.