Фамилия Шойган — редкая и неочевидная для русского уха. Она не вписывается в типичную модель на -ов, -ин или -ский, и это сразу подсказывает, что её корни, скорее всего, не великорусские, а иноязычные. В русском языке слово «шойган» не имеет прямого лексического значения, поэтому объяснение нужно искать за его пределами.

Наиболее правдоподобная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) существует основа «шой» или «шуй», означающая «левый», а также «спокойный», «тихий». Суффикс «-ган» в тюркских языках — распространённый аффикс, образующий прилагательные или причастия (например, «утырган» — сидящий). Таким образом, «шойган» можно перевести как «левша» (левый человек) или, в переносном смысле, «спокойный», «уравновешенный». Прозвище Левша было распространено в крестьянской среде и часто становилось основой для фамилий, но в тюркском варианте оно приобрело характерную огласовку.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая, связывает фамилию с этнонимом. У некоторых народов Сибири (например, у тувинцев) встречается родоплеменное название «шойган». В этом случае фамилия могла указывать на принадлежность предка к определённому роду или племени, что типично для кочевых культур, где фамилии нередко происходят от названия рода.

Обратите внимание на окончание. Фамилия Шойган не имеет русского патронимического суффикса, поэтому она могла быть зафиксирована в документах в исходной, «голой» форме. Это характерно для фамилий, которые возникли на окраинах Российской империи, в Поволжье, на Урале или в Сибири, где русские писцы записывали прозвища инородцев без изменений. Иногда такие фамилии «обрусевали» позже, добавляя окончание -ов (Шойганов), но исходный вариант Шойган сохранился как более архаичный.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шойкин, Шойгу) подтверждает тюркскую версию. Фамилия министра обороны Сергея Шойгу — тувинского происхождения, и здесь мы видим ту же основу, но в другой грамматической форме. Шойган и Шойгу — это, по сути, однокоренные варианты, разошедшиеся в разных диалектах или при разной записи.

Таким образом, предки человека с фамилией Шойган, скорее всего, были тюркоязычными крестьянами или кочевниками, получившими прозвище по физической особенности (левша) или по характеру (спокойный). Географически фамилия тяготеет к регионам с тюркским населением — от Татарстана до Тувы.