Фамилия Шойко звучит на украинский лад, и это первая подсказка в её разгадке. Характерный суффикс -ко — один из самых распространённых в украинской ономастике. Он выполнял роль уменьшительно-ласкательного или просто фамильного форманта, превращая прозвище или имя в наследственную фамилию. Поэтому перед нами типичная украинская фамилия, образованная либо от прозвища, либо от производной формы крестильного имени.

Основа «Шой» неочевидна, и здесь есть две основные версии. Первая: Шой — это просторечная, сокращённая форма имени Исайя (Исай) или Шимон (Семён). В украинском языке имя Исай могло звучать как Шай, а уменьшительная форма дала бы Шойко. Вторая, более прозрачная версия, связывает фамилию с диалектным словом «шой» или «шоя». В некоторых западных говорах так называли шум, гам или суету. Тогда Шойко — это прозвище шумного, непоседливого человека, того, кто постоянно «шойкает» или создаёт «шой». Эта версия кажется правдоподобнее, поскольку прозвища по характеру давали чаще, чем переделывали редкие церковные имена.

Географически фамилия тяготеет к западу Украины, чаще всего встречается в Закарпатье и на Волыни. Там суффикс -ко особенно активен, а местные диалекты сохранили много слов, не вошедших в литературный язык. В отличие от фамилий на -енко, которые охватывают всю Украину, Шойко — более локальная, «западная» фамилия.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Есть фамилия Шайко — с основой на «а», что может указывать на иное произношение того же имени (Исайя) или на другое прозвище. Шойко же стоит ближе к звукоподражательной или глагольной основе. В русском языке такой корень не встречается, что ещё раз подтверждает: фамилия чисто украинская, и её носители — выходцы из западных регионов Украины.

Таким образом, предок современного Шойко с высокой вероятностью получил прозвище за свой голос или манеру поведения — возможно, он был крикуном, заводилой или просто человеком, который говорил громко и много. Модель образования фамилии проста: прозвище Шой + патронимический суффикс -ко, закрепившийся как фамилия. Никакого отношения к военному делу или знатному происхождению эта фамилия не имеет — это бытовое прозвище, данное в сельской общине.