Фамилия Шпартенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая указывает на происхождение по отцу: Шпартенко буквально значит «сын Шпарты» или «потомок Шпарты». Суффикс -енко в XVII–XVIII веках был самым продуктивным в левобережной Украине, особенно среди казачества и мещан, и со временем стал восприниматься как родовой, а не только отчественный.

Основа фамилии — прозвище Шпарта. Его происхождение спорно, и здесь возможны два основных пути. Первый: от немецкого или голландского слова, означающего «сбережение», «экономия» (нем. Sparren, нидерл. sparen). В таком случае Шпартой могли прозвать бережливого, расчетливого хозяина. Вторая версия связывает прозвище с глаголом «шпарить» (парить, ошпаривать кипятком) или диалектным «шпартать» — делать что-то быстро, резко. Тогда Шпарта — человек горячий, торопливый или работающий споро. Первая версия выглядит правдоподобнее, учитывая, что в Украине, особенно на западе, было заметно влияние немецкой колонизации и ремесленных традиций.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые типичны для великорусских территорий, Шпартенко — однозначно украинская фамилия, и её географическое ядро, скорее всего, находится в центральных или западных областях Украины. Редкость основы (фамилия нечастотная) говорит о том, что прозвище Шпарта было локальным и не превратилось в массовое имя. Сравните с более распространёнными украинскими фамилиями на ту же модель: Шевченко, Коваленко — они образованы от названий профессий, тогда как Шпартенко сохраняет связь с личной характеристикой или прозвищем первого носителя.