Фамилия Штефирца — редкий случай в русском ономастиконе. С первого взгляда ясно: перед нами не исконно русская фамилия, а результат адаптации иноязычной основы. Её носители почти наверняка имеют корни, уходящие в западные или южные славянские земли, а возможно, и в среду немецкоязычных переселенцев.

В основе фамилии лежит имя собственное. Скорее всего, это производное от уменьшительной формы имени Штефан — южнославянского и немецкого аналога греческого Стефан (στεφανος — «венок», «венец»). В славянской среде имя трансформировалось в Степан, а в хорватской, словенской или чешской — в Штефан. От него образовали ласкательную форму Штефир (или Штефирц) с помощью суффикса -ир/-иц, характерного для западнославянских языков. Фамилия Штефирца — это, по сути, притяжательная форма: «чей?» — Штефирцев, то есть потомок человека по прозвищу Штефир (маленький Штефан).

Ключевой элемент, который выдаёт происхождение фамилии, — суффикс -ца. В русском языке фамилии с таким окончанием обычно указывают на польское, украинское или белорусское влияние (сравните: Ковальчук — Ковальца, или польские фамилии на -ец). Однако в данном случае -ца — это не суффикс, а окончание, которое появилось при русификации. Исходная форма могла звучать как Штефирц (немецкая фамилия, означающая «сын Штефира») или Штефирец (чешская/словацкая). При склонении по-русски «Штефирца» — это родительный падеж, но со временем эта форма закрепилась как именительный: человек — Штефирца, нет — Штефирцы.

Географически фамилия могла закрепиться на территории бывшей Австро-Венгерской империи: в Словении, Хорватии, западной Украине (Галиция) или у поволжских немцев. В Россию её могли принести переселенцы-ремесленники или крестьяне в XVIII–XIX веках. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или мещанская: знатные роды с таким окончанием почти не встречаются.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия. В некоторых говорах «штефир» могло быть прозвищем от диалектного глагола со значением «шататься», «бродить» или «стелить». Но она не выдерживает критики: ни в одном серьёзном словаре (Унбегаун, Никонов) такое слово не фиксируется. Основная версия — антропонимическая, от имени Стефан через уменьшительную форму.