Фамилия Штукарин — редкий пример, когда прозвище предка не связано с характером или внешностью, а прямо указывает на ремесло. В основе лежит слово «штукарь» — так в южных и западных говорах называли маляра или штукатура. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Штукарин — сын штукаря. Модель образования типична для русских фамилий от профессий (Кузнецов, Плотников), но сама основа встречается нечасто.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные примеры отнесены к профессиональным прозвищам, но «штукарь» стоит в стороне от более частых «маляр» и «штукатур». Вероятно, прозвище закрепилось в тех регионах, где слово «штукарить» означало «заниматься отделкой, штукатуркой» — в основном в южнорусских и украинских землях.

Менее правдоподобна версия о происхождении от слова «штука» в значении «хитрость, проделка»: тогда Штукарин означал бы «сын хитреца» или «сын пройдохи». Но в таком случае ожидалась бы фамилия Штукин или Штучкин, а суффикс -арь указывает на деятеля, а не на качество. Поэтому ремесленная версия убедительнее.

Стоит заметить, что фамилия Штукарин не встречается в старых боярских списках или дворянских родословных — это фамилия крестьянская или мещанская, возникшая не раньше XVII–XVIII веков, когда профессиональные прозвища начали закрепляться как фамилии. Носители её, скорее всего, жили в городах или крупных сёлах, где требовались отделочные работы.

В современных справочниках фамилия остаётся редкой, сконцентрированной в центральных и южных областях России. Поиск по базам показывает единичные случаи в Воронежской и Ростовской областях, что косвенно подтверждает южное происхождение.