Фамилия Шуфрын — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить самый простой вариант — искусственное происхождение или позднее заимствование, — то наиболее вероятной выглядит еврейская (ашкеназская) этимология. Основа «шуфр» восходит к идишу или ивриту: слово «шуфра» (שופרא) означает «красота», «благолепие». В таком случае фамилия образована по распространённой модели с суффиксом -ин, который в восточноевропейской еврейской ономастике нередко заменял славянское -ов/-ев. Прямое значение — «красивый», «пригожий», то есть прозвище или характеристика предка.

Словообразовательный разбор подтверждает, что это патронимическая или прозвищная фамилия на -ин, а не на -ов. Суффикс -ин в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность к матери (Марьин) или на прозвище, оканчивающееся на согласный (Козин, Птицын). В еврейских фамилиях он мог закрепляться механически, как адаптация к славянской модели. Альтернативная версия — связь с западнославянским или немецким корнем «шурф» (нем. Schurf — разведочная шахта, шурф). Тогда Шуфрын мог быть прозвищем горняка или геологоразведчика. Однако эта гипотеза слабее: переход «шурф» → «шуфр» маловероятен, а фамилия Шурфин или Шурфов встречается, но не Шуфрын.

География фамилии также указывает на её вероятные корни. Основная масса носителей Шуфрын фиксируется в черте оседлости — на территории современных Украины, Беларуси и Молдовы, а также в диаспоре. Это типичный ареал еврейских фамилий, образованных от абстрактных понятий или качеств. В отличие от фамилий, привязанных к профессии или месту, Шуфрын — качественная характеристика, что роднит её с такими фамилиями, как Шейнин (от «шейн» — красивый) или Файн (тонкий, изящный).

Ударение в фамилии, судя по произносительной норме, падает на первый слог — Шу́фрын, что также характерно для слов идиша с коротким гласным. Встречается вариант Шуфры́н, но он менее распространён и, скорее всего, вторичен.

В русском контексте фамилия могла подвергнуться вторичной русификации: суффикс -ин воспринимался как русский, а основа осталась без изменений. Никаких данных о дворянском происхождении или принадлежности к казачеству нет — это фамилия мещанского или ремесленного сословия, что типично для её этимологии.