Фамилия Шухарева — женская форма от Шухарев, а та, в свою очередь, принадлежит к группе русских фамилий на -ев, образованных от прозвищ с основой на мягкий согласный. В ономастике суффикс -ев указывает на принадлежность: Шухарев — это сын или потомок человека по прозвищу Шухарь. Само прозвище Шухарь в русских говорах имело два основных значения, и оба связаны с характером или поведением.

В большинстве диалектов «шухарь» — это «плут», «пройдоха», «ловкий обманщик» или, в более мягком варианте, «озорник», «беспокойный человек». В. И. Даль в своём словаре фиксирует слово «шухарить» в значении «проказничать», «шалить», а «шухарный» — «шаловливый». Таким образом, первый и наиболее вероятный источник фамилии — прозвище непоседливого, хитрого или озорного предка. Второе, более редкое значение, зафиксированное в северных и сибирских говорах, — «шухарь» как «пугало», «страшилище». В этом случае прозвище могли дать человеку неопрятного вида или тому, кто любил пугать, рассказывать страшные истории.

Географически фамилия Шухарев (и Шухарева) тяготеет к центральным и северным областям России. Встречается она в старых переписях Вологодской, Костромской и Пермской губерний, что косвенно подтверждает связь с севернорусской лексикой. Интересно, что однокоренные фамилии — Шухалов, Шухин, Шухмин — образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что говорит о широком бытовании корня «шух-» в русской антропонимии.

Принадлежность к сословию у Шухаревых была разной: в документах XVIII–XIX веков встречаются и крестьяне, и мещане, и купцы. Например, в «Списке купцов города Кунгура» за 1812 год упоминается купец Шухарев, что говорит о том, что прозвище не мешало его носителю заниматься торговлей. Таким образом, фамилия Шухарева — это не про профессию, а про яркую личностную черту: предок был либо заметным озорником, либо человеком с необычной внешностью, и эта характеристика закрепилась за его родом.