Фамилия Шуклинова — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Шуклинов. А та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Шукля. Разбор этой фамилии интересен не столько корнем, сколько моделью: суффикс -ин (а не более распространённый -ов) указывает на принадлежность к конкретному человеку, главе семьи. Шуклинов буквально означает «сын Шукли» или «человек из рода Шукли».

Корень «шукл-» — тёмный и редкий. В русских говорах слово «шукля» имело несколько значений. В вятских и пермских диалектах так называли неповоротливого, медлительного человека, увальня. В других регионах «шукля» могла означать мешок или куль, что давало прозвище торговцу, носильщику или просто человеку с мешковатой фигурой. Есть и версия, что это усечённая форма от имени Шуклий (производное от древнерусского Шука, Шукан, связанного с рыбой щукой), но она менее убедительна из-за отсутствия распространённых параллелей.

Суффикс -ин в фамилиях на -ин типичен для северных и центральных регионов России, где патронимы образовывались от основ на -а/-я. Это указывает на возможное происхождение рода из Владимирской, Костромской, Вологодской или Пермской губерний. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще давали по имени отца (Иван → Иванов), -ин закреплялся за прозвищами и личными именами, оканчивавшимися на согласный или гласный: Шукля → Шуклин.

Сословная принадлежность предков Шуклиновых, скорее всего, была крестьянской или посадской. Прозвище Шукля не несёт дворянского оттенка — оно бытовое, описывающее внешность или характер. Встречаемость фамилии невысока, что говорит о локальном бытовании: такие фамилии не разносились массовыми переселениями, а оставались в пределах одного уезда или волости.

Стоит отметить, что в некоторых говорах «шукля» могло быть ироничным прозвищем для человека, который «шукает», то есть ищет, вынюхивает, — отсюда возможна связь с любопытным или назойливым поведением. В любом случае, основа фамилии — живое народное слово, а не книжное имя, и это делает её ценной для изучения диалектной лексики.