Фамилия Шуклин имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркского прозвища Шукля. Фамилия Шуклин происходит от прозвища Шукля. Это прозвище восходит к тюркскому слову «cuk» (или «suk»), что означает «ресница», и образованному от него с помощью суффикса –li слова «sukli». Этот суффикс имеет значение обладания, следовательно, слово «sukli» переводится как «обладающий красивыми ресницами». В русской адаптации тюркское прозвище Sukli получило окончание женского рода –я. В результате появилось прозвище Шукля, от которого и образована фамилия Шуклин. Также нельзя исключать связи фамилии с глаголом «шукать», то есть «искать». Прозвище Шукля впервые упоминается в первой половине XV века: так, согласно «Ономастикону» Веселовского звали переяславского крестьянина Алешку Шуклю. В родословных фамилия Шуклин встречается с 1628 года в связи с упоминанием о дворянском роде Шуклиных.