Фамилия Шулупата — редкий случай, когда окончание -а не женское, а мужское, и ударение падает на последний слог. В русском языке такие фамилии чаще всего украинского или белорусского происхождения: они не склоняются по падежам (Иван Шулупата, у Петра Шулупаты) и указывают на прозвищную основу.

Корень «шулуп» почти наверняка связан с украинским словом «шулупати» — шелушить, снимать кожуру, лущить. В говорах «шулупай» или «шулупатый» могло означать человека, который занимался лущением зерна, очисткой семечек или, в переносном смысле, — дотошного, «обдирающего» работника. Прозвища от глаголов с суффиксом -ата (-атый) типичны для южнорусских и украинских земель: «бородата», «губата», «очката». Шулупата — тот, кого прозвали за привычку или работу, связанную с шелухой.

Вторая версия, менее вероятная, — связь с диалектным «шулуп» (скорлупа, кожура). Тогда фамилия могла закрепиться за человеком с грубой, «шелушащейся» кожей или за тем, кто носил неопрятную, облезлую одежду. Но в ономастике предпочтение отдают профессиональным прозвищам, а не внешним описаниям, если для последних нет прямых свидетельств.

Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Сумской и Полтавской областям Украины, а также к приграничным районам России (Брянщина, Курщина). В переписях XIX века носители Шулупаты почти поголовно числились государственными крестьянами или казаками — то есть не были крепостными. Это косвенно подтверждает, что прозвище возникло в среде свободного сельского населения, где ремесло или особенность работы становились родовым именем.

Суффикс -ата в мужской фамилии — архаичная черта, характерная для прозвищ, которые так и не превратились в стандартные -ов/-ев. Такие фамилии хорошо сохранились в сельской местности, где их не «исправляли» при переписях. Так что Шулупата — прямое свидетельство того, что предок носителя был известен под прозвищем, которое не успело или не захотело обрасти патронимическим суффиксом.