Фамилия Шунаков имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркского прозвища Шунак. Фамилия Шунаков образована от прозвища Шунак, которое в переводе на русский язык означает «безухий». Вероятно, это прозвище указывало на определенные внешние особенности человека. Однако нельзя исключить, что фамилия Шунаков связана с топонимом. Так, название Шунак носит гора в Карагандинской области. Возможно, основатель рода Шунаковых жил на этой горе, либо неподалеку от нее.