Фамилия Шупилин — наглядный пример того, как в основе русской фамилии может лежать не крестильное имя, а прозвище, связанное с физической особенностью или манерой поведения. Модель образования здесь классическая: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Шупилин — это потомок человека по прозвищу Шупила.

Ключевой вопрос — что означало само слово «шупила». Самая прямая и правдоподобная версия отсылает к диалектному глаголу «шупить» — щуриться, жмуриться, смотреть прищурясь. В говорах встречается и существительное «шупила» — тот, кто щурится, близорукий человек, или же человек с хитринкой, который смотрит исподлобья. Прозвище могли дать как за реальный дефект зрения, так и за характерную привычку прищуривать глаза при разговоре или работе. Это объяснение лежит на поверхности и не требует привлечения натянутых иноязычных параллелей.

Менее распространённая, но тоже имеющая право на существование версия связывает фамилию с украинским или белорусским корнем «шуп» — так в некоторых регионах называли гниль, труху в дереве, а также негодный, слабый предмет. В таком случае Шупила — это прозвище нерадивого или хилого человека. Однако эта гипотеза слабее первой, поскольку не объясняет суффикс -ил-а, типичный для прозвищ по действию (ср. «зубрила», «мутила»), а не по качеству.

Географически фамилия Шупилин тяготеет к центральным и южнорусским областям, а также к Поволжью. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении: прозвище Шупила, скорее всего, закрепилось в одной или нескольких соседних деревнях, а затем распространилось с переселенцами. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые массово образовывались от церковных имён, Шупилин остался в числе более редких «прозвищных» фамилий, которые сохранили в себе живую народную речь.